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Un moyen très simple de représenter un graphe est d’utiliser les outils open sources Graphviz développés par AT&T. Le projet Graphviz regroupe un certain nombre de choses simultanément (ce qui ne le rend pas facile à appréhender au premier abord).

• le langage de description ou format DOT, qui permet de décrire des graphes dans un format texte.
• différents outils (en ligne de commande) pour faire le rendu des graphes (en fait, il y en a plusieurs, en fonction du type de rendu que l’on veut obtenir, voir plus bas ‘options avancées’).
• des librairies qui peuvent être incluses dans d’autres applications.
• des applications qui exploitent les librairies, ou le format de fichier DOT.

Premiers exemples

Fichier .dot Hello Word

La syntaxe DOT qui permet de définir les graphes est vraiment très souple. Beaucoup de choses peuvent être définies implicitement. Mentionnons par exemple :

• créer un arc entre deux noeuds, va aussi créer les deux noeuds.
• par défaut, l’étiquette d’un noeud est égale à son nom.
• …

Toutes ces conventions permettent d’avoir des fichiers .dot vraiment simple. Le site officiel propose le fichier suivant comme traditionnel Hello world :

Mettons qu’on enregistre le contenu précédent dans un fichier hello.dot. Voici le rendu de ce fichier :

Graphe Hello World

Ligne de commande

Le programme en ligne de commande dot propose de très nombreuses options. Après s’être placé dans le dossier contenant le fichier hello.dot (à l’aide de la commande cd), l’utilisation basique pour générer un fichier est :

ainsi on généra un fichier PDF :

ou un fichier PNG :

De très nombreux formats sont supportés, et on pourra utiliser l’option -Tgif, -Tsvg et ainsi de suite…

Editer les fichiers texte

N’importe quel éditeur de texte peut faire l’affaire (y compris le terminal lui-même).

Néanmoins, il est plus agréable d’en choisir un qui supporte la coloration syntaxique et propose différentes options…

Il existe un Bundle (textmate_graphviz_bundle) pour mon éditeur de prédilection TextMate.

Logiciels de visualisation

Graphviz pour Mac OS X

Cette application permet de visualiser les graphes dans un logiciel muni d’une interface graphique. On retrouve le Look and Feel Apple.

Ainsi si l’application est choisie pour ouvrir par défaut les fichiers .dot, ceux-ci deviennent double cliquable…

graphe cluster graphviz

En savoir plus sur le site officiel de Graphviz pour Mac OS X réalisée par Pixelglow Software

KGraphViewer pour linux

Il me fallait un équivalent de l’application précédente pour Ubuntu… Je me suis tourné vers KGraphViewer qui s’installe très facilement (par le gestionnaire d’application).

graphe cluster dans KGraphViewer

En savoir plus : fiche de l’application sur gna.org ou sur kde-apps.org

Options avancées

Choisir sont moteur de rendu

La définition d’un graphe (sans aucune information de mise en forme) laisse beaucoup de souplesse au moteur de rendu. Plusieurs moteurs ont ainsi été développés, chaque moteur privilégiant certaines caractéristiques (position des noeuds, minimum de croisement d’arc…)

Dans les logiciels évoqués ci-dessus, ces moteurs de rendu correspondent à autant d’options d’agencement. En ligne de commande, les différents moteurs disposent d’options similaires.

dot – Représentation hiérarchique :

C’est l’outil en ligne de commande le plus connu… il est bien adapté aux graphes orientés (il hiérarchise des noeuds).

neato – minimisation de l’énergie.

twopi – représentation radiale.

circo – représentation circulaire.

fdp – représentation alternative pour les graphes non orientés.

Autres services

On trouve l’utilisation de la syntaxe DOT partout :

Intégrer un fichier dans un document LaTex

Le script Python dot2tex permet d’intégrer des graphes dot dans des documents LaTex utilisant les packages LaTex PGF and TikZ. (voir également la section TikZ and PGF sur TeXample.net pour des exemples sur ces packages).

Extensions et plug-ins

Pour intégrer des graphes en syntaxe dot sur différentes plates-formes de publication :

• Extension Graphviz pour Mediawiki.
• EHT Graphviz plugin wordpress.

Robot Graphy dans google wave

Le robot Graphy permet de d’inclure des graphes dans Google wave.

Pour s’en servir, il suffit d’inviter le robot (graph-wave@appspot.com) dans la conversation, et de débuter un blips par #!dot.

Google Wave - Graphy

Voir aussi

Documentation officielle (en)
graphviz [dot and/or neato] liste et description des différents programmes en lignes de commande disponible.
An Introduction to GraphViz and dot

Un gros quart d’heure suffit à comprendre le fonctionnement. Les ressources sont bien faites :

• Apache Ant – Tutorial: Hello World with Ant
• Apache Ant – User Manual
• Apache Ant – Frequently Asked Questions

La meilleure méthode consiste comme souvent à essayer soit même…
Un exemple bien fait permet de comprendre le fonctionnement, il suffit ensuite de faire du copier-coller intelligent.

Les bons IDE (Eclipse dans mon cas) apportent leur lot d’outils pour se simplifier la vie :

• la coloration syntaxique et la vérification du fichier XML
• une interface graphique pour lancer les tâches (clic droit sur le fichier « Run as ant task… »)

Je n’ai qu’un seul conseil : n’hésiter pas à vous lancer !

Voir aussi

• Le site officiel de Ant
• Ant sur le site de wikipedia

Program testing can be used to prove the presence of bugs, but never their absence! (1970)

Edsger Dijkstra

David Gries

We should run test cases not to look for bugs, but to increase our confidence in a program we are quite sure is correct. (1981)

David Gries

Préparer :

• 4 oeufs durs
• Les éplucher et les couper dans le sans de la longueur

Mélanger (écraser dans un grand bol à la fourchette) :

• Les jaunes d’oeuf dur
• une petite boite (150g nets égouttés) de thon
• de la moutarde (~2 cuillères à soupe)
• de l’huile d’olive (~2 cuillères à soupe)
• du persil

Remplir les blancs d’oeuf avec la préparation.

Script

#!/usr/bin/php
<?php
/**
 * RGB TO COLOR - CONVERTER
 * syntax: rgb2color.php (red) (green) (blue)
 *     ex: rgb2color.php 255 252 114
 */
	if($argc != 4) {
		die("RGB TO COLOR - CONVERTER\n   syntax: rgb2color.php (red) (green) (blue)\n       ex: rgb2color.php 255 252 114\n");
	}

	$r = $argv[1];
	$g = $argv[2];
	$b = $argv[3];

	echo rgb2color($r, $g, $b)."\n";

  /**
   * Convert a RGB color into a Hex-Color String
   * @param <int> $red : red component (0-255)
   * @param <int> $green : green component (0-255)
   * @param <int> $blue : blue component (0-255)
   * @return <string> the color
   */
	function rgb2color($red, $green, $blue) {
		return "#".dec2hex($red,2).dec2hex($green,2).dec2hex($blue,2);
	}

  /**
   * Convert a decimal value to a hexadecimal value (with some control of the format)
   * @param <int> $value : the decimal value
   * @param optionnal <int> $size : the minimal length that the hex value should have
   * @param optionnal <type> $char : the padding character
   * @return <string> the hexadecimal value
   */
	function dec2hex($value, $size = 0, $char = '0') {
		$ret = dechex($value);
		while(strlen($ret) < $size ) {
			$ret = $char.$ret;
		}
		return $ret;
	}
?>

Utilisation

Ce script est écrit pour être utilisé directement dans un terminal. Il s’utilise en indiquant les trois valeurs des composante RGB sous forme de nombre (entre 0 et 255) séparé par un espace. Exemple :

Il exploite la possibilité de passer des arguments à un script PHP. Le script est écrit pour Mac OS X, pour un autre système d’exploitation, il faudra peut être adapter la ligne Sha bang.

Détail des fonctions

Evidement les fonctions appelées par le script sont réutilisables ailleurs.

rgb2color

function rgb2color($red, $green, $blue)

Il s’agit de la fonction principale. Le script ne fait que vérifier le nombres de paramètres et appelle cette fonction.

Les arguments sont :

• $red (int) la valeur de la composante rouge (0-255)
• $green (int) la valeur de la composante verte (0-255)
• $blue (int) la valeur de la composante bleue (0-255)

La valeur de retour est la couleur.

dec2hex

function dec2hex($value, $size = 0, $char = '0')

Les paramètres sont :

• $value (int) la valeur à convertir
• $size (int) la taille minimale de la chaine retournée
• $char (char) le caractère de remplissage (pour les chaînes trop courtes)

La valeur retournée est la chaine hexadécimale formatée

Cette fonction ce comporte comme la fonction dec2hex de MATLAB

Pour éditer le fichier dans le terminal avec le super utilisateur, taper dans le terminal :

error_reporting

Par défaut, PHP est configuré pour afficher toutes les erreurs sans les remarques et avertissements (non fatales) :

Suivant les conseils donnés dans cet article, j’ai passé la ligne d’error_reporting à :

Ce réglage permet selon moi de mieux débugguer son code (en effet, souvent les avertissements donnés sont justifiés et je n’aime pas l’aspect trop permissif de PHP – comme le fait de pouvoir utilisé une variable non initialisée par exemple).

• $_SERVER (manuel PHP)
• Les principales entrées de $_SERVER en PHP

• SOAP
• REST
• XML-RPC

Voir aussi : Service Web

Sécurisation des échanges

• OAuth